MRI已广泛地应用于头颅、脊柱、胸腔（心脏）、腹部、骨骼等部位的检查，获得真实的解剖图像。并可进行横断面、冠状面、矢状面及斜面等多方面的扫描，软组织分辨率高，并可直接显示血管，安全、无损伤。但有价格高、检查时间长、不易显示钙化区等缺点。具体什么样病才选择做MRI呢？
(1) 头颅疾病 对于脑退行性变、缺血性疾病、小脑与脑干部病变应优选MRI检查，因为与CT相比，小脑与脑干病变、脑白质病变异常显示率均优于CT检查。对有神经系统症状，考虑有占位性或退行性病变，或弥漫性血管栓塞，而CT检查正常者，均应进行MRI检查。
(2) 脊柱病变 通过T1、T2时间的改变情况区分髓内、髓外肿瘤。
MRI对癫痫灶的确定有一定的帮助，由于临床上常用的原子核是氢质子，在大脑灰质中氢几乎都存在于水中，而白质中有相当数量的氢包含在脂质内，因此很容易区分开。CT是反映脑癌症同理解剖改变的，而MRI则能更早地反映部的血流及缺血组织、脱髓鞘组织，故能较早、清晰地显示脑部的癫痫灶，特别是对较小病灶、颞叶底部的病变具有特别的敏感性。
